Gua Jepang 5 ini terletak di Ngreco, Seloharjo, Pundong, Bantul, DIY. Koordinat UTM : 49 M  X : 0426243, Y : 9115543 Mdpl : 361. Gua ini mempunyai ukuran Lubang pengintaian sisi luar : 52 x 25 cm, Lubang pengintaian sisi dalam : 40 x 25 cm, Tebal dinding : 62 cm, Panjang ruang dalam : 260 cm, Lebar ruang dalam : 220 cm, Tinggi ruang dalam : 165 cm. Gua menghadap ke barat dengan sebuah pintu masuk di sebelah barat. Pada sisi timur terdapat sebuah lubang pengintaian, sedangkan lubang ventilasi berada di dinding atas sisi timur laut.