Gua Jepang 6 ini terletak di Ngreco, Seloharjo, Pundong, Bantul, DIY. Koordinat UTM : 49 M X : 0426206, Y : 9115503 Mdpl : 359. Gua ini mempunyai ukuran Panjang ruang dalam : 650 cm, Lebar ruang dalam : 300 cm, Tinggi ruang dalam : 220 cm, Panjang meja dinding : 510 cm, Lebar meja dinding : 36 cm. Gua menghadap ke selatan, berdenah persegi panjang, dan mempunyai sebuah pintu masuk di sebelah timur. Pada sisi timur terdapat sebuah lubang pengintaian, sedangkan lubang ventilasi berada di dinding atas sisi timur laut.
