Museum Manusia Purba Sangiran dibangun di atas lahan yang berada di wilayah 2 kabupaten, yaitu Kabupaten Sragen dan Kabupaten Karanganyar. Tiga Klaster dikembangkan di Kabupaten Sragen dan satu buah Klaster dikembangkan di Kabupaten Karanganyar.
Untuk Wilayah Kabupaten Sragen, dibangun Museum Manusia Purba Sangiran Klaster Krikilan, Klaster Ngebung, dan 2 buah museum di Klaster Bukuran. Sedangkan di wilayah Kabupaten Karanganyar dibangun sebuah museum klaster, yaitu Museum Manusia Purba Sangiran Klaster Dayu.
