Song Santen terletak di Dusun Semampir, Desa Semugih, Kecamatan Rongkop, Kabupaten Gunung Kidul, Daerah Istimewa Yogyakarta pada titik koordinat 49L X: 0473728 dan Y: 9103600 dan ketinggian 368 mdpl. Song ini terletak pada lereng bukit karst yang letaknya di sebelah selatan Pasar Hewan Kendal sekitar 50 meter. Vegetasi tanaman keras, seperti pohon jati, dan semak belukar cukup lebat pada jalan sepanjang lereng bukit untuk sampai ke mulut gua. Meskipun demikian, terdapat jalan setapak menuju ke arah mulut gua tersebut.
Aspek morfologis. Arah hadap gua adalah barat daya. Lebar mulut gua adalah 10,5 meter. Sementara tinggi mulut gua pada bagian tertinggi di sebelah timur adalah 2,12 meter, terendah di sebelah barat 0,88 meter. Panjang dinding atau ukuran jarak dari mulut gua ke dinding yang segaris dengannya adalah 12,5 meter. Lebar dinding 15,72 meter. Lantai pada mulut gua lebih tinggi dibandingkan lantai pada bagian dalam gua. Terdapat reruntuhan stalagtit dan stalagmit di lantai gua. Ditemukan juga sebuah fragmen gerabah bagian dasar sebuah wadah dan sebuah tulang kaki hewan. Sebaran kerang darat cukup banyak di lantai gua.
