Gua Kukup II terletak di pinggir Pantai Kukup, Ngepung, Desa Kemadang, Kecamatan Tanjungsari, Kabupaten Gunungkidul, Daerah Istimewa Yogyakarta. Secara astronomis Gua Kukup II terletak pada koordinat UTM 49 X: 0450847 dan Y: 9100911, berada pada ketinggian 18 mdpal. Gua Kukup II memiliki ukuran pintu dengan tinggi 12 meter dan lebar 10,5 meter, kedalamannya 11,5 m.
Gua Kukup II berada di tanah Sultan Ground. Digunakan sebagai tempat labuhan abu jenazah. Song menghadap ke selatan. Berupa cerukan. Di atas mulut gua ditumbuhi tanaman.
(Sumber: Laporan Inventarisasi Gua dan Song di Kecamatan Tanjungsari, Kabupaten Gunungkidul Tahun 2012)