Gua Jepang 2 ini terletak di Ngreco, Seloharjo, Pundong, Bantul, DIY. Koordinat UTM : 49 M X : 0426324, Y : 9115667 Mdpl : 362.
- Gua di atas tanah
Bangunan ini merupakan bangunan pengintai. Hal ini terlihat dari adanya lubang-lubang berbentuk persegi pada bidang-bidangnya. Bangunan berbentuk silinder dengan bidang segi delapan yang terbagi menjadi 2 ukuran, yaitu 4 bidang berukuran 100 x 140 cm dan 4 bidang berukuran 70 x 140 cm. Bagian atas bangunan ini tertutup, sedangkan lubang-lubang pengintaian terdapat pada bidang-bidang yang lebih luas dengan menghadap kearah barat, timur, utara, dan selatan. Lubang pengintaian berbentuk melebar keluar. Pada dinding bagian dalam terdapat graffiti dari cat merah.
- Gua di bawah tanah.
Bangunan gua ini menghadap ke timur, terbagi menjadi 3 ruang dengan denah bangunan berbentuk bujur sangkar. Dinding, atap, dan lantai berspesi semen. Pada bagian atap terdapat perkuatan besi. Ruang I merupakan ruangan utama, terdapat pintu masuk berukuran 110 x 180 cm. Ruang II terletak disisi selatan ruang I, dengan pintu masuk disisi utara. Di ruangan ini terdapat meja dinding yang menempel pada dinding sisi barat dengan ukuran 200 x 40 x 55 cm. Ruang III terletak disisi selatan ruang II dan di sebelah ruang II. Ruang ini merupakan ruang penghubung dengan bangunan di atas tanah, yaitu lubang penghubung di langit-langit.
