Gua Jepang 16 ini terletak di Ngreco, Seloharjo, Pundong, Bantul, DIY. Koordinat UTM : 49 M X : 0426217, Y : 9115352, Mdpl : 319. Gua ini mempunyai pintu berukuran Lebar 135 cm. Meja dinding berukuran Lebar 40 cm dan Panjang 360 cm. Ketinggian dari tanah : 90 cm. Bangunan dengan dua pintu masuk di sisi utara dan selatan dan sering disebut sebagai gua dapur. Bangunan ini berada di dataran yang rata di kaki bukit. Di depan bangunan merupakan tanah lapang. Menurut keterangan penduduk, tanah lapang ini dahulu digunakan untuk upacara tentara Jepang. Bangunan berdenah segi empatpersegi panjang. Di bagian tengah diberi semacam tembok pembatas, tetapi antara sisi sisi yang satu dengan sisi/ruang yang lainnya dihubungkan dengan pintu.Pintu masuk ada padasudut-sudut ruangan dan bangunannya menghadap ke arah barat. Kondisi ruangan saat ini, apabila turun hujan air masuk ke dalam ruangan. Hal tersebut terlihat adanya bekas lumpur di dalam ruangan. Pada dinding sisi timur bagian dalam terdapat semacam lubang tungku sebanyak 4 buah yang tembus ke luar atap. Sedangkan di dinding sisi timur bagian utara hanya terdapat satu lubang tungku. Pada dinding ruang dalam sisi selatan terdapat meja dinding, disamping itu ada 1 buah lubang ventilasi serta semacam bak air yang rusak.